Konijn Peter gaat vandaag op reis naar de locaties in de buurt van zijn huis. Onze held wil zoveel mogelijk wortels verzamelen om ze op te slaan voor de winter. Jij in het spel Doki Doki Ninjin zal hem hierbij helpen. Voor je zal een konijn op het scherm zichtbaar zijn, dat zich op een bepaalde locatie zal bevinden. Met behulp van de bedieningstoetsen stuur je de acties. Je held zal langs de weg vooruit moeten rennen en verschillende obstakels en vallen moeten overwinnen. Zodra je een wortel op de weg ziet liggen, raap je hem op. Voor het plukken van wortels in het spel Doki Doki Ninjin krijg je punten en kan het konijn verschillende handige bonussen krijgen.