Agent Square Pants ontwaakt een wespennest van terrorisme. Level na level, springt hij omhoog op veren, klimt op de touwen, vliegt over de afgrond ... Niemand zal ontsnappen de schurk Sponge Bob. Echter, kunnen ze niet, want in dit spel alleen van de terroristen het hoofd uitsteekt. De taak van onze onverschrokken held vinden de bom, krijgen om het in zijn geheel, te nemen en breng aan de hulpeloze hoofd bandiet.