De laatste keer dat Indiana Jones het graf van Pharaoh Tuttankhamun verkende, vond hij een gloeiende gouden schakelaar in een van de koepels en besloot om het zelf te passen. Het zou echter niet zo moeten zijn met de artefacten die de onzichtbare monsters bewaken. Vanaf de grond rees de geest van Agni op en probeerde de acties van Indi uit te stellen. Dat hij je karakter niet kon doden, je moet hem helpen ontsnappen. Ondergrondse tunnel Tomb Run, hoewel vrij van monsters, maar nog steeds een moeilijke plaats vanwege de aanwezigheid van allerlei obstakels onderweg. Ren samen met Indy in de richting van de grot, rennen rond elke keer barrières en stenen pilaren.
