In de blokkwereld brak er oorlog uit tussen de twee staten. Jij in de game Blocky Squad moet de geavanceerde eenheden van een van de staten die als eerste het gevecht voerden, opdracht geven. Om de vijand te vernietigen en je soldaten te redden, moet je je talent als een strateeg laten zien. Voordat je op het scherm verschijnt, kun je het slagveld zien. Met behulp van een speciaal paneel kun je je soldaten bellen. Elk pictogram op het paneel is verantwoordelijk voor soldaten met een specifiek type wapens. Als je een klein detachement hebt, kun je ze in de strijd gooien. Als je de vijand vernietigt, verdien je punten. Op hen kun je nieuwe rekruten oproepen of nieuwe typen soldaten openen.
