In de stad Zveropolis woedt een epidemie, die wordt gedragen door druppeltjes in de lucht. Het konijn Judith pakte ook de infectie op en nu is haar keel erg pijnlijk. Nadat ze enkele dagen ziek was geweest en merkte dat ze niet beter zou worden, besloot ze naar het ziekenhuis te gaan. Jij in de game Judy's Throat Doctor zal haar behandelende arts zijn. Het eerste dat je moet doen, is de keel van Judith onderzoeken en haar diagnosticeren. Vervolgens gebruikt u verschillende medische apparaten en medicijnen om de behandeling te starten. Om dit proces te vergemakkelijken, is er een hint in het spel dat je de volgorde en volgorde van je acties vertelt.
