Jongen Tom heeft een zeer slechte neus en werd daarom 's ochtends wakker en ging naar het ziekenhuis. Jij in de game Funny Nose Surgery werkt als een arts in de kliniek waarmee de jongen contact heeft opgenomen. Je zult hem naar je kantoor en daar moeten brengen om de neus van de jongen te onderzoeken. U moet bepalen welke ziekte het meer is. Na de diagnose zul je met zijn behandeling beginnen. U doet dit met behulp van speciale medische instrumenten en medicijnen. Na een reeks acties in een bepaalde volgorde, zul je de jongen volledig genezen.
