Particle Clicker neemt je mee naar het fysicalab van een van de virtuele instituten. Je gaat experimenten uitvoeren in deeltjesdetectoren. Door op een rond groot deeltje te klikken en er vonken uit te snijden, kun je alle beschikbare prestaties ontgrendelen. Waaronder om normale financiering te bereiken, waarmee je studenten kunt aantrekken om te werken, als een goedkope beroepsbevolking, en vervolgens afgestudeerde studenten. Ze zullen je ploegen in de hoop een proefschrift te verdedigen. De meest gekwalificeerde assistenten zijn wetenschappers, waaraan ze moeten worden besteed.