In de verre toekomst ontwikkelden wetenschappers een speciaal miniatuurschip waarmee verschillende soorten virussen konden worden vernietigd. Jij in het spel Virus Hunter zal het besturen. Voordat u op het scherm komt, ziet u het menselijk lichaam waarin dit toestel zich zal bevinden. Hij zal langzaam vooruit vliegen en snelheid winnen. Onderweg zullen verschillende bacteriën ontstaan. Je moet nauwkeurig schieten met speciaal gereedschap om in deze bacteriën te vallen en ze dus te vernietigen.
