De dappere ninja ontving een bevel van het hoofd van zijn bevel om het kasteel van de aristocraat te penetreren en daar documenten te stelen. Jij in de Ninja Run Up And Down-game helpt hem in deze avonturen. Je personage moet naar het kasteel rennen langs een weg die door een bepaald gebied loopt. Onderweg komt hij verschillende vallen en monsters tegen. Als je naar ze toe rent, moet je je held dwingen om door al deze gevaren te springen en door de lucht te vliegen.
