Beroemde ninjaschildpadden besteden elke dag aan het trainen van hun vaardigheden in hand-tot-hand gevechten, behendigheid en reactie. Vandaag neem je in Extreme Skate 5000 deel aan een van hun trainingssessies. Voordat je op het scherm komt zie je een riooltunnel, die ergens in de verte gaat. Een van de schildpadden die op een skateboard staat, rent er langs en wint aan snelheid. Hij zal geleidelijk snelheid oppikken. Je moet goed naar de weg kijken. Voor je verschijnen verschillende obstakels op het scherm. Sommigen van hen zul je met snelheid rond moeten gaan, terwijl anderen er gewoon overheen springen. Je held zal deze acties uitvoeren wanneer je op de overeenkomstige bedieningstoetsen drukt. Onderweg kom je ook verschillende handige items tegen die je moet verzamelen.