In het tweede deel van Water Sort Puzzle 2 blijf je experimenteren met verschillende vloeistoffen. Voordat je op het scherm komt zie je een speelveld waarop twee bekers staan. Ze worden gedeeltelijk gevuld met vloeistoffen. U moet alle vloeistoffen gelijkmatig over de twee bekers verdelen. Kijk goed hoe ze worden gevuld. Neem vervolgens degene met meer vloeistof en sleep deze met behulp van de muis naar degene met minder vloeistof. Dan giet je de vloeistof over je oog. Als je de vloeistofniveaus gelijk maakt, krijg je punten en ga je door naar het volgende niveau van het spel.