In een verre wondere wereld leven wezens zoals Pokemon. Ze zijn verdeeld in groepen die natuurgeesten aanbidden. Eens voerden aanbidders van de geesten van vuur en water een ritueel uit en riepen deze goddelijke entiteiten naar deze wereld. Maar het bleken erg boze geesten te zijn en raakten uit de hand. Nu is de hele planeet in chaos en vinden er voortdurend natuurrampen plaats. Jij in de game Pokemon Emerald Version zal ze moeten bevechten. Voor je op het scherm zie je een bepaald gebied waarin je personages zich zullen bevinden. Ze zullen bijvoorbeeld de geest van vuur aanvallen. U stuurt hun acties met behulp van een speciaal bedieningspaneel. Met zijn hulp dwing je je Pokémon om verschillende magische spreuken toe te passen waarmee ze hun tegenstander schade toebrengen.
