In een wereld waar intelligente dieren leven, is in de hoofdstad een nieuw ziekenhuis geopend. Het wordt geleid door een vriendelijke pandadokter genaamd Tom. Vandaag heeft hij een receptie en jij in de game Best Doctor In Animal World zal hem helpen zijn werk te doen. Voor je op het scherm zie je de hal waar de bezoekers zullen zijn. Selecteer de eerste patiënt door met de muis te klikken en hij zal in uw kantoor zijn. Allereerst moet u met behulp van verschillende medische instrumenten de patiënt onderzoeken om een diagnose te stellen. Als je hier problemen mee hebt, is er een hulp in het spel die je de volgorde van je acties laat zien. Nadat u een diagnose heeft gesteld, voert u een kuur uit met behulp van medicijnen. Als u klaar bent, is uw patiënt weer helemaal gezond en kunt u door naar de volgende bezoeker.