Een kwaadaardige en gekke wetenschapper stal een familierecept voor het maken van pizza van een beroemde chef-kok in de stad genaamd Mario. De gek wil pizza bijzondere kwaliteiten geven en ervoor zorgen dat hij op mensen jaagt. Onze held besloot het kasteel van de wetenschapper binnen te gaan en zijn recept terug te stelen. Jij in het spel Pizza Tower zal hem hierbij helpen. Voor je op het scherm zie je de kasteelzaal waarin je personage zich zal bevinden. Hij zal een speciaal wapen in zijn handen hebben. Met behulp van de bedieningstoetsen laat je je held vooruitgaan. Onderweg zal hij obstakels tegenkomen die hij moet beklimmen. Hij zal ook verschillende soorten vallen moeten omzeilen die in het kasteel zijn geïnstalleerd. Zodra je een pizzamonster tegenkomt, moet je er het vuur op openen. Door nauwkeurig te schieten, vernietig je het en krijg je er punten voor.