De Dark Ninja Order infiltreerde in de tempel en ontvoerde meester Chen. Nu moeten de dappere ninja Go en zijn vrienden naar de tempel van de duistere orde gaan en hun leraar bevrijden. Jij in het spel NinjaGo Chen's Return zal hem hierbij helpen. Voor je op het scherm zie je je helden die zich in een bepaald gebied zullen bevinden. Elk van hen zal worden bewapend met specifieke wapens. Met de bedieningstoetsen kunt u elk teken besturen. U moet verder gaan en alles zorgvuldig onderzoeken. Verzamel verschillende items die overal verspreid zullen worden. Ze leveren je punten op en kunnen je belonen met verschillende bonussen. Zodra je de vijand ontmoet, val hem aan. Opvallende slagen met je wapen, je vernietigt de vijand en krijgt hier ook een bepaald aantal punten voor.