Een groep terroristen is de metro van de stad binnengegaan, die een reeks explosies wil uitvoeren en veel mensen wil doden. Jij in het spel Subway Clash Remastered als onderdeel van een speciale eenheid zal de metro moeten afdalen, alle tegenstanders moeten opsporen en vernietigen. Je held zal door tunnels en metrostations bewegen. Zodra je de vijand opmerkt, begint er een vuurgevecht. Je moet je wapen op de vijand richten en nauwkeurig schieten om hem te vernietigen. Verzamel na de dood van de vijand trofeeën die eruit kunnen vallen.