Een dappere kikker genaamd Frog werd getraind in de tempel van de ninja-krijgers. Om de titel van meester te ontvangen, moet hij nu een aantal missies voltooien die hem door het hoofd van de orde zijn toevertrouwd. In het spel Ninja Frog Adventure help je Frog op zijn avonturen. Je held moet door veel verschillende locaties gaan en overal gouden munten en andere voorwerpen verzamelen. Met behulp van de bedieningstoetsen wijs je de kikker in welke richting hij moet bewegen. Heel vaak zullen er onderweg verschillende soorten vallen en obstakels zijn. Je zult de held door al deze gevaarlijke delen van de weg moeten laten springen en door de lucht moeten laten vliegen. Ook zal de held worden opgejaagd door verschillende monsters en levende vliegenzwammen. Hij kan er gewoon overheen springen of op hun hoofd vallen en ze zo vernietigen. Voor het doden van een vijand ontvang je punten.
