Een leger van monsters viel het koninkrijk van de kleine boselfen binnen. In Fruit Legions: Monsters Siege leid je de verdediging van het koninkrijk. Met behulp van een speciale gereedschapskist zul je speciale militaire bloemen moeten kweken. Daarna moet je de weg onderzoeken waarlangs het leger van monsters zich voortbeweegt. Erlangs, op strategisch belangrijke plaatsen, moet je deze bloemen plaatsen. Zodra de monsters verschijnen, worden je bloemen geactiveerd en beginnen ze op ze te schieten. Door monsters te vernietigen, ontvang je punten. Als je er een bepaald aantal hebt verzameld, kun je nieuwe, krachtigere bloemen laten groeien.
