Een astronaut genaamd Thomas, die door de melkweg reist, ontdekte een buitenaards ruimteschip dat in de ruimte zweefde. Onze held besloot te landen en het te verkennen. In Spooked In Space help je hem op dit avontuur. Voor je op het scherm zie je je personage, die zich in een van de compartimenten van het schip zal bevinden. Met behulp van de bedieningstoetsen dwing je hem om vooruit te gaan. Er verschijnen verschillende obstakels en vallen voor je held. Sommigen van hen zal je held kunnen omzeilen. Een deel waar hij overheen zal moeten springen. Maar hij zal andere vallen moeten neutraliseren door bepaalde puzzels of puzzels op te lossen. Help het personage onderweg verschillende items te verzamelen die je punten opleveren.