De beroemde wetenschapper Joseph voert tegenwoordig experimenten uit op grappige slijmerige wezens. Jij in het spel Bop the Blox zal hem helpen bij zijn experimenten. Voor experimenten heeft hij een bepaald aantal wezens nodig. Op het scherm verschijnt een vierkant speelveld, opgedeeld in cellen. Elk van hen zal een wezen met een bepaalde vorm en kleur bevatten. Je zult alles zorgvuldig moeten onderzoeken en een cluster van volledig identieke wezens vinden. Selecteer ze nu allemaal met je muis. Dan verdwijnen deze wezens van het scherm en krijg je hiervoor punten. Je moet proberen zoveel mogelijk punten te scoren in de toegewezen tijd om het level te voltooien.
