Een groep kubussen van verschillende kleuren die de wereld rondreist, viel in een val. De helden bevonden zich in een kerker en in het spel Zero Squares moet je ze helpen eruit te komen. Voor je op het scherm zie je de ruimte waarin je kubus zich zal bevinden. U kunt de bedieningstoetsen gebruiken om zijn acties te besturen. Ergens in de kamer zie je een portaal dat leidt naar het volgende niveau van het spel. Je zult de kubus langs een bepaalde route moeten nemen en het zo maken dat het in het portaal komt. Onderweg kunnen er obstakels zijn die je personage moet vermijden.
