In een verre wondere wereld leven intelligente vruchten. Net als jij en ik houden ze van sport en organiseren ze vaak verschillende soorten wedstrijden. Je personage Watermelon, die zal deelnemen aan hardloopwedstrijden. Jij in het spel Watermelon Run 3d zal hem helpen om ze te winnen. Voor je op het scherm zie je je personage, die geleidelijk aan snelheid zal maken om op de loopband te rennen. Met behulp van de bedieningstoetsen moet je je Watermelon rond verschillende obstakels op zijn pad laten rennen. Ook zal je held onderweg over gaten in de grond en andere gevaarlijke gebieden moeten springen. Er zullen verschillende soorten fruit op de weg liggen, die je moet helpen Watermelon te verzamelen en er punten voor te krijgen.
