Om te genieten van het pop-it rubberen speelgoed door op de hobbels te klikken, moet je het eerst verzamelen. Dit is precies het doel in Pop It Jigsaw. Er verschijnt een veld voor je, dat moet worden gevuld met stukjes. Hieronder staan de fragmenten die je gaat overbrengen en instellen zodat je een soort speelgoed krijgt. Zodra de verbinding tot stand is gebracht, kun je spelen door op de uitstulpingen te drukken en er munten voor te krijgen. Ze stapelen zich op in de rechterbovenhoek. Na verloop van tijd kunnen ze worden besteed aan nieuwe skins en achtergronden in Pop It Jigsaw. Er zijn meer dan twee dozijn puzzels in het spel en daarom krijg je een heleboel verschillende pop-it-speeltjes.