In het derde deel van het spel Doctor Teeth 3 blijf je werken als tandarts in een kliniek. Vandaag komen er verschillende kinderpatiënten naar je toe. Nadat u een patiënt hebt geselecteerd, bevindt u zich op uw kantoor. Het kind gaat voor je zitten in een stoel met zijn mond open. Allereerst moet u zijn mondholte zeer zorgvuldig onderzoeken en een diagnose stellen. Daarna start u met de behandeling. Hiervoor heeft u bepaalde tandheelkundige instrumenten en medicijnen nodig. Wat je ook bent gelukt in het spel, er is hulp. De volgorde van uw acties zal aan u worden aangegeven in de vorm van hints. Als u klaar bent, is de patiënt gezond en kunt u doorgaan met de volgende behandeling.
