Sonic moet zijn vriend Tails vinden om de plannen van de slechterik Dr. Robotnik in Sonic the Hedgehog te verstoren. De dokter heeft veel dieren uit het bos gekidnapt en staat op het punt wrede experimenten met ze uit te voeren. Na hen is het onwaarschijnlijk dat de dieren zullen overleven. Sonic kan dit niet toestaan, dus hij is klaar om alles te doen om de gevangenen te redden. Samen met zijn vriend de vos zal hij door het bos rennen, de arme gevangenen vinden en ze bevrijden. Maar zorg ervoor dat de held zelf niet in een kooi belandt. In het bos zijn overal vallen, de schurk is niet vies van het vangen van Sonic, dit zal de meest waardevolle prooi voor hem zijn, maar dit laat je niet toe in Sonic the Hedgehog.
