Er is een kwaadwillende hacker verschenen in de cybernetische wereld, die alles in de buurt wil vernietigen. Jij in het spel Cyberchase Quest 1: Motherboard zal het moeten neutraliseren. Aan het begin van het spel ga je naar een speciaal laboratorium waar je een personage voor jezelf gaat maken dat over bepaalde vaardigheden beschikt. Daarna zie je de held voor je. Je krijgt opdrachten van een robotmeisje. Ze zullen allemaal te maken hebben met de zoektocht naar de Hacker. Je zult deze speurtochten moeten voltooien. Heel vaak moet je een bepaalde puzzel of rebus oplossen om de volgende taak te voltooien. Zodra alle speurtochten zijn voltooid, kun je de hacker neutraliseren en deze wereld redden in het spel Cyberchase Quest 1: Motherboard.