Een man genaamd Ben gaat vandaag naar een afgelegen gebied om buitenaardse wezens te vangen die de lokale bevolking terroriseren. Jij in het spel Ben 10 Alien Catcher gaat hem hierbij helpen. Voor je op het scherm zal de auto van je held zichtbaar zijn, die zich op een bepaalde locatie zal bevinden. Buitenaardse wezens zullen op verschillende plaatsen in de ruimte rond de auto verschijnen. Ze zijn slechts enkele seconden zichtbaar. U moet snel reageren om ze met de muis aan te klikken. Zo vang je deze aliens. Voor elk van hen krijg je punten in het spel Ben 10 Alien Catcher.