Het leger van Skibidi-toiletten brak de stad binnen en nu kan geen van de inwoners zich veilig voelen. Ze zijn buitengewoon wreed en agressief, maar de mensheid heeft nogal wat van zulke vijanden. Veel verschrikkelijker is het feit dat ze mensen in hun eigen soort kunnen veranderen en hun aantal voortdurend kunnen vergroten. Om dit in het spel Skibidi Toilets: Infection te voorkomen, heeft het stadsbestuur besloten geen mensen de straat op te laten, zelfs geen soldaten, omdat ze gevaar lopen. In plaats daarvan werden de Cameramannen uitgenodigd, omdat ze immuniteit hebben tegen de gevolgen van monsters en een schat aan ervaring hebben in het bestrijden ervan. Jij bestuurt een van deze speciale agenten. Neem de wapens op en begin de straten van de stad te kammen. Let goed op de situatie rondom, want Skibidi-toiletten kunnen vanuit elke richting verschijnen en je moet klaar zijn. Zodra je de vijand vindt, vang hem dan in je vizier en begin met schieten. Voor elk vernietigd monster krijg je punten en kun je deze gebruiken om munitie aan te vullen en je wapens te verbeteren. Elk niveau heeft een bepaald aantal Skibidi-toiletten. Je moet ze allemaal elimineren om door te gaan naar de volgende fase in Skibidi Toilets: Infection.