In het tweede deel van het spel Vega Mix 2: Mystery Of Island gaan jij en een groep wetenschappers verder met het verkennen van het mysterieuze eiland dat ze hebben ontdekt. Dwalend over het eiland zul je verschillende puzzels uit de categorie van drie op een rij moeten oplossen. Voor je op het scherm zie je het speelveld, dat binnenin in cellen zal worden verdeeld. Ze zullen allemaal worden gevuld met verschillende items. Jouw taak is om alles zorgvuldig te onderzoeken en de identieke objecten in de buurt te vinden. Hiervan moet u, door één object één cel in een willekeurige richting te verplaatsen, een rij van ten minste drie objecten instellen. Je haalt deze items dus uit het speelveld en hiervoor krijg je punten in het spel Vega Mix 2: Mystery Of Island.
