Er wordt een nieuwe kleurblokpuzzel geïntroduceerd in Brain Bloxx. Het gaat om twee soorten blokfiguren: rood en geel. De taak is om zoveel mogelijk figuren met verschillende vormen op een klein vierkant veld te plaatsen. In dit geval zet je rood in op geel en andersom. Het figuur moet volledig rechtop staan; als het niet past, zie je groene strepen op plaatsen waar het niet past, en dit is onaanvaardbaar. Het Brain Bloxx-spel eindigt als er geen plaatsen meer zijn om de stukken te plaatsen. Scoor het maximale aantal punten, en om dit te doen, plaatst u de stukken rationeel en denkt u vooruit.