Veelkleurige bubbels worden op jouw bevel opgeblazen en komen omhoog in Bubble Merge. De botsing van twee identieke bellen zal resulteren in een samensmelting tot één grotere bel van een andere kleur. Zo zal de set bubbelballen op het veld voortdurend veranderen. Als het veld helemaal gevuld is, eindigt het spel, maar je kunt dit moment uitstellen door de ballen vaker te dwingen te combineren. Bij elke verbinding ontvang je een bepaald aantal punten. Het totaalbedrag wordt rechtsboven weergegeven. De voorraad van de volgende bal staat bovenaan aangegeven, je weet vooraf welke bal als volgende verschijnt in Bubble Merge, dit maakt het plannen makkelijker.