Er wachten je drie soorten puzzels in Brainstorming 2D. Het eerste type puzzel bestaat uit gepixelde afbeeldingen die je van het speelveld moet verwijderen door ze op gekleurde randen te slaan. Het tweede type is mahjong, waarbij je niet twee identieke tegels tegelijk moet verwijderen, maar drie tegelijk, door ze onderaan een horizontaal paneel te plaatsen. Het derde type is een logische ketting waarmee je kunt raden welke tegels het getekende personage bedoelde. Selecteer drie verschillende tegels onder aan het scherm en plaats ze in vierkante cellen. Klik dan op de gele knop en de tegels verschijnen op het speelveld. Links en rechts ziet u informatie die u vertelt waar de fout zit. Hiermee kunt u de juiste locatie berekenen in Brainstormen 2D.