Er bestaan verlaten steden en dat is een bekend feit, maar je kon je nooit voorstellen dat je in een van deze steden terecht zou komen in Mystery Town Escape. De dag ervoor besloot je je familie te bezoeken, sprong in de auto en ging op pad. De weg was bekend en duurde meestal niet langer dan vier uur. Maar halverwege kwam je opeens reparatiewerkzaamheden tegen en borden gaven een omweg aan langs een onverharde weg, die zich enkele kilometers kon uitstrekken. De helft van de weg is gepasseerd, je wilt niet meer terug, dus je bent verder gegaan. De weg bleek onbekend en steeds onheilspellender, en al snel verscheen er een stad aan de horizon. Je besluit te stoppen, iets te eten te halen en bij te tanken. Maar de stad bleek volkomen leeg en vervallen. Waar je brandstof en voedsel kunt krijgen is een probleem in Mystery Town Escape.