Wetenschappers over de hele wereld, elk op hun eigen vakgebied, werken onvermoeibaar om een aantal grote ontdekkingen te doen. Slechts enkelen slagen er echter in; de meeste onderzoeken zijn nog niet voltooid. Hun financiering is gesloten vanwege gebrek aan belofte of mislukkingen in experimenten. De heldinnen van het spel Library Mysteries zijn studenten van een van de beroemde universiteiten. Amelia, Candice en Ava hebben een passie voor wetenschap en willen beroemd worden. Ze hoorden dat een van de professoren van hun instelling bezig was met serieuze wetenschappelijke ontwikkeling, maar het project werd gesloten en de professor verdween. Meisjes willen graag zijn werken in de universiteitsbibliotheek vinden en bestuderen. Help de meisjes in Library Mysteries.