In het Neon Saga-spel worden op elk niveau boter-kaas-en-eieren-puzzels verzameld. Om het level te voltooien, los je de puzzel op. Je symbolen zijn neonkruisen en de virtuele vijand zal laten zien wat hij wil: grappige geesten, robots, schedels, buitenaardse wezens, duivels en andere ongewone karakters. Op elk niveau wachten er verrassingen op je. Het oplossen van de puzzels is eenvoudig en je zult bijna altijd winnen als je gefocust blijft in Neon Saga. Om ervoor te zorgen dat je niet bang bent, verschijnen vóór het begin van het level bovenaan het scherm de naam en het pictogram van het personage dat zich tegen je kruisen zal verzetten.