In het spel Shoggoth Run doe je je onderdompeling met het karakter in een verschrikkelijke nachtmerrie. Het team van onderzoekers werkte in het Arctische gebied en werd per ongeluk wakker van het oude schepsel Shoggoth, slapend in de gletsjer. Dit is een monster, dat bestaat uit protoplasma en in staat is om de vorm te nemen van een monster dat je in de ergste droom voordoet. Een detachering van wetenschappers werd door zichzelf uitgewist, de enige overlevende was overgebleven en je moet hem helpen om gered te worden. De ongelukkige man loopt langs een donkere tunnel, verlicht de weg met een zaklamp, niet naar zijn voeten kijken. Direct zijn bewegingen zodat hij obstakels omzeilt, waardevolle objecten en bommen verzamelen om Shoggoth op te blazen.