De ninjaschildpadden keerden terug van hun volgende opdracht en ontdekten dat hun leraar Splinter vermist was. In Manhattan waren de laatste dagen onrustig, er waren veel mutanten en iemand achter hen. Leonardo is de meester van de katan-gevechten, de leider van het team Raphael behandelt de Sayes vakkundig, Donethello gebruikt een speciaal personeel en Michelangelo geeft de voorkeur aan Nunchuck. Ze zullen in april geholpen worden, ze bezit meesterlijk een groene honkbal magie.
