Nadat de aardbewoners op een van de planeten waren geland, organiseerde ze daar een onderzoeksbasis en begon ze een stad te bouwen voor immigranten die spoedig hier zouden aankomen. Zoals later bleek, woonde het buitenaardse ras op het aangrenzende vasteland. Ze vonden een basis van aardbewoners en stuurden een leger om het te vernietigen. Jij in het spel Base Defense moet de verdediging baseren. Met behulp van een speciaal controlepaneel bel je de soldaten en stuur je ze de strijd in. Deel je krachten competent uit. Elk van je krijgers is eigenaar van hun wapens en heeft zijn eigen vechteigenschappen.
