Voor de dappere en handige ninja is een van de moeilijkste obstakels slechts een mogelijkheid om nog sterker en bekwamer te worden. Maar in Flip ninja bevond de held zich in een mystiek labyrint, waar het meer zou kosten dan de kracht en het vermogen om zijn lichaam perfect te beheersen. Er is meer belangrijke logica en vindingrijkheid, en je kunt je vaardigheden delen met de held. De combinatie van je vaardigheden en karakter is de sleutel tot succes bij het voltooien van niveautaken. Je moet door het doolhof gaan en rode strepen verzamelen. Ninja overwint de weg met de hulp van salto's. Maar tegelijkertijd ziet hij het einde van de weg niet en alleen een barrière kan hem tegenhouden.