De jonge piloot Tom kreeg een bevel van zijn commando om het ruimtestation van de vijand te infiltreren. Om erop te landen, zal hij zijn ruimteschip moeten gebruiken. Jij in de game X-Trench Run moet onze held helpen deze acties te voltooien. Op je schip vlieg je langs de ruimtebasis. Onderweg kom je verschillende obstakels en vallen tegen. Wanneer je in de ruimte op je ruimteschip manoeuvreert, zul je een botsing met deze obstakels moeten vermijden.
