De held van het spel Dead Nest is een slachtoffer van het experiment. Hij werd terug tot leven gebracht om naar een wereld te worden bewoond die wordt bewoond door dode vogels. Dit is een speciale wereld waar de doden niet in de grond liggen, maar zich gedragen alsof ze leven, dus er is geen plaats voor de levenden. De held moet een nieuw wapen testen op de vogels genaamd de Groene Straal. Het is uniek, niet alleen omdat het alles wat leeft en niet leeft kan vernietigen, maar ook in zijn vermogen om te herstellen als gevolg van aanvulling van zielenergie. Hieronder zie je groene lichten, er zijn er zes, wat betekent dat het aantal schoten van het personage beperkt is. Om ze goed te maken, dood je grote vogels om hun energie op te nemen.
