Gekke professor Thomas voert opnieuw experimenten uit in zijn geheime laboratorium. Een mislukte poging om verschillende chemicaliën te mengen veroorzaakte een explosie en ballen gevuld met gifgas verschenen in de lucht. Geleidelijk vullen ze de kamer. Jij in het spel Professor Bubble Shooter moet de wetenschapper helpen om ze kwijt te raken. Hiervoor zal onze held een speciaal kanon gebruiken dat enkele ladingen afvuurt. Je moet een cluster van bubbels van dezelfde kleur vinden en er een lading van exact dezelfde kleur doorheen laten. Je zult ze dus vernietigen en er punten voor krijgen.
