Een komeet, die niemand kon opmerken, stortte plotseling op de aarde en veroorzaakte een stofwolk. Het gebeurde allemaal in de woestijn en er raakten maar weinig mensen gewond. Iedereen dacht dat de problemen aan ons voorbij waren gegaan, maar dat was nog maar het begin. Het stof bevatte bacteriën die mensen in zombies veranderden. Toen de wolk de lucht in steeg en rond de planeet ging reizen, begon het op sommige plaatsen te regenen, waarna daar zombies begonnen te verschijnen. Jij, als soldaat, kreeg de taak om de doden te vinden en te vernietigen. Alle strijdkrachten zijn in actie gekomen om deze infectie in Zombie In Ruine aan te pakken.