De wereld van de gelei-bewoners is groot en divers, en onder hen is er een clan van ninjastrijders. Ze verschillen van gewone gelei met een zwart verband, terwijl ze zelf elke kleur kunnen hebben. Deze clan daagt je ook uit in het spel Jelly Ninja. Je hoeft alleen maar de spelmodus te kiezen: voor een tijdje of tegen fouten. De getimede modus gaat ervan uit dat je een minuut speelt, maar het kan duren als je een vliegende wekker opvangt. In de foutloze modus speel je totdat de schaal aan de rechterkant helemaal rood wordt, en dit zal gebeuren als je een bepaald aantal gelei mist voordat je ze snijdt. Er zijn veel gelei-ninja's die niet kunnen worden verslagen door met een zwaard te vegen.
