Boven een kolonie aardbewoners, die zich op een van de planeten bevindt, verschenen vreemde veelkleurige bubbels. Het bleek dat ze gevuld zijn met gif. Geleidelijk dalen ze af op de kolonie aardbewoners. In het spel Bubble Planets moet je ze allemaal vernietigen. Hiervoor gebruik je een speciaal kanon. Ze schiet enkele ladingen die ook een bepaalde kleur hebben. Je zult alle bubbels zorgvuldig moeten onderzoeken en een plaats moeten vinden waar bepaalde objecten geclusterd zijn. Ze moeten dezelfde kleur hebben als uw lading. Daarna vuur je een schot. De kern die een cluster van objecten raakt, zal ze laten exploderen en je krijgt hiervoor een bepaald aantal punten. Jouw taak is om het speelveld zo snel mogelijk van alle bubbels te ontdoen door deze acties uit te voeren.
