In een magisch land leeft zo'n geweldig wezen Pixelstein. Eenmaal op kerstavond besloot onze held naar een verre vallei te gaan, waar op een bepaald moment geschenken verschijnen. Je personage wil er zoveel mogelijk van verzamelen om ze aan hun vrienden te presenteren. In Pixelkenstein: Merry Merry Christmas help je hem op dit avontuur. Voordat je op het scherm komt, zie je een weg die door een bepaald gebied loopt. Overal zie je verspreide geschenken die je held, onder jouw leiding, zal moeten verzamelen. Hierbij zal hij worden gehinderd door verschillende obstakels en vallen. Sommige zul je moeten omzeilen, terwijl je over andere moet springen.
