De vrolijke Doggy pup is nog klein en vol kracht en energie, hij wil constant eten en rennen. In Doggy Run kan hij zijn beide behoeften combineren met jouw hulp. De held zal rennen, en je klikt op hem als je over een ander obstakel moet springen, maar ze kunnen compleet anders zijn: grote kubussen, ontevreden mollen, boze zonnebloemen en zelfs vliegende vogels. Probeer de puppy zo dicht mogelijk bij het obstakel te krijgen en spring dan. Verzamel onderweg verschillende goodies zodat de held niet zonder kracht komt te zitten en hij zo lang kan rennen als je wilt, totdat je het beu bent hem te besturen in Doggy Run.