De leider van het Power Rangers-team heeft één onafgemaakte persoonlijke zaak die hij moet afronden en hij wil geen hulp van vrienden, maar hij zal die van jou graag gebruiken in de Power Rangers Ninja Run-game. Het feit is dat zijn beste ninjavriend onlangs is verdwenen. Hij ging naar een confrontatie met een van zijn vijanden, maar keerde nooit terug. Er is al een hele week geen nieuws, en dit klinkt niet als een krijger die gewend is om snel alle problemen op te lossen. De Rode Ranger besloot in de voetsporen van zijn vriend te treden en zijn lot te achterhalen, en indien nodig hulp te bieden. Help hem in Power Rangers Ninja Run, het pad is lang en erg gevaarlijk. Op de platforms worden vallen geplaatst die ontploffen als er iemand in de buurt is, dus wees voorzichtig.