Spider-Man heeft soms ongebruikelijke dingen meegemaakt, vooral de laatste tijd. Hij kan in zijn huis gaan slapen en op een heel andere plek wakker worden. Dit is een soort magie of supertechnologie, je moet erachter komen voordat het erger wordt. In de game Marvel Ultimate Spider-man Mystery City bevinden jij en een superheld je in een mysterieuze stad die niet op de kaart staat. Hoogstwaarschijnlijk bevindt hij zich in een parallel universum. Spider-Man wil begrijpen hoe hij in de ruimte wordt vervoerd en waarom precies hier. Om door de stad te bewegen. Het is noodzakelijk om precies op de blauwe tegels te springen en te landen, anders kan de held gewond raken in Marvel Ultimate Spider-man Mystery City.