Het doel van de piraten is gouden piasters, en hoe meer, hoe beter. Een enorm fregat met een team piraten aan boord onder de vlag van de Jolly Roger verhuist naar een klein eiland waar kisten met gouden munten verborgen zijn. De kapitein wil ze ophalen en met pensioen gaan, ze verdelen onder de bemanningsleden. Maar toen we het eiland naderden, verscheen plotseling een vreemd cluster van veelkleurige bubbels Bubble Shooter Pirates 3, en piasters schitterden ertussen. De piraten vonden dit helemaal niet leuk en ze besloten bellen te schieten om het goud op te rapen. Stel je kanon af en schiet. Als drie of meer bubbels van dezelfde kleur bij elkaar komen, barsten ze in Bubble Shooter Pirates 3.